北交所不包括老三板，二者同属全国股转公司体系，但为独立板块，老三板是新三板的子板块，北交所则是由原新三板精选层升级而来的独立交易所。
要理清二者关系，需从资本市场层级架构说起。中国多层次资本市场分为沪深交易所、北交所、新三板与老三板。其中，老三板正式名称为“全国中小企业股份转让系统两网公司及退市公司板块”，2001年设立，承接原STAQ、NET系统遗留的两网股及沪深交易所退市公司股票，代码以400开头。新三板即全国中小企业股份转让系统，2013年揭牌，包含基础层、创新层与老三板三个板块。北交所2021年9月注册成立，11月开市，由原新三板精选层整体平移升级而来，是独立的证券交易所，代码以8、43开头，与新三板并行运营。
全国股转公司是新三板与老三板的运营主体，也是北交所的全资母公司，三者同属一个监管体系，但市场定位与功能完全独立。北交所定位为服务创新型中小企业的主阵地，上市公司需在新三板创新层连续挂牌满12个月，经审核后上市，属于场内上市交易市场。老三板则定位为退市企业与历史遗留股份的承接平台，属于场外非上市股份转让市场，流动性低、风险高，交易方式为集合竞价，每周1、3、5次不等，涨跌幅限制5%。
在转板机制上，北交所与老三板无直接转板通道。老三板企业若想登陆北交所，必须先摘牌，重新在新三板基础层挂牌，逐步升入创新层并满12个月后，才可申请北交所上市，流程与普通企业一致。反之，北交所上市公司退市后，通常回归新三板创新层或基础层，而非老三板，只有彻底退市且符合条件的企业才会进入老三板。
理清这一关系有助于避免概念混淆与投资误区。部分用户将老三板与北交所混为一谈，误以为老三板是北交所的“低价板块”，实则二者在上市标准、交易规则、流动性与风险上差异巨大。北交所聚焦优质创新企业，与数字货币领域的区块链、Web3等创新项目有更多契合点；老三板以退市企业为主，投资风险极高，与币圈主流投资逻辑不符。
